www.youtube.com/watch?v=eAg0Y-Qoa18&list=PLY0OaF78qqGAxKX91WuRigHpwBU0C2SB_&index=45 카플란 마이어 생존분석 p = 1 - (사망자 수 / 생존자 수) p1 : 첫번째 구간의 생존 비율 p2 : 두번째 구간의 생존 비율 모든 구간의 생존 비율을 곱해서 생존 확률을 추정한다. 생존 함수 추정 치료제 2를 처방한 환자에 대해 생존 함수 계산하기 5번 환자의 상태가 모름, 7번 환자의 상태가 생존이므로 이들의 생존시간데이터는 중도 절단 데이터이다. 생존 함수 곡선 1일차, 2일차 ... 로 갈수록 생존 함수가 점점 하락하는 것을 볼 수 있다. 6일차에 중도절단 데이터가 발생하고 표시해놓는다. 집단 간 생존함수 비교 치료제 1이 치료제 2보다 생..

3 Methods In this section, we describe our methodology for providing personalized treatment recommendations using DeepSurv. First, we describe the architecture and training details of DeepSurv, an open source Python module that applies recent deep learning techniques to a nonlinear Cox proportional hazards network. Second, we define DeepSurv as a prognostic model and show how to use the network’..

모수적 방법(parametric method): 관측 값이 어느 특정한 확률분포, 예를 들면 정규분포, 이항분 포 등을 따른다고 전제한 후 그 분포의 모수(parameter)에 대한 검정을 실시하는 방법이다. 비모수적 방법(nonparametric method): 관측 값이 어느 특정한 확률분포를 따른다고 전제할 수 없거나 또는 모집단에 대한 아무런 정보가 없는 경우에 실시하는 검정방법으로 모수에 대한 언급 이 없으며 분포무관 방법이라고도 한다. 요약하면 자료가 정규분포가 아니거나 표본의 크기가 작으면 분포에 대한 기본가정을 필요로 하지 않는 통계적 기법이다. Non-parametric: 데이터의 feature와 생존 시간 분포 정보를 사용하지 않는 방법입니다. 분포 정보를 알 수 없을 때 유용하지만 예..

Tensorflow 텐서플로우는 테아노와 유사하게 네트워크 기반의 심볼릭 그래프를 사용합니다. 파이썬과 C/C++ 모두 사용이 가능하지만 주력은 파이썬인 것 같습니다. 모바일과 서버 환경 모두를 고려하고 있습니다. 부가적으로 텐서보드(TensorBoard)를 통해 비주얼라이제이션을 지원합니다. 단점은 성능상에서 다른 경쟁자들에 비해 다소 뒤떨어집니다. 그리고 테아노의 scan 같은 네트워크에 있는 심볼릭들을 루핑(loop)할 수 있는 기능은 없습니다. Theano 테아노는 심볼릭 텐서 그래프를 사용하는 최초의 프레임워크로 토치 같은 프레임워크보다 더 유연합니다. 테아노를 기반으로 하는 고수준 프레임워크들도 존재하고 있고 텐서플로우나 토치에서는 지원되지 않는 윈도우즈 환경에서도 사용할 수 있습니다. 반면 ..

github.com/jaredleekatzman/DeepSurv jaredleekatzman/DeepSurv DeepSurv is a deep learning approach to survival analysis. - jaredleekatzman/DeepSurv github.com Medical practitioners use survival models to explore and understand the relationships between patients' covariates (e.g. clinical and genetic features) and the effectiveness of various treatment options. Standard survival models like the li..

Cox Proportional Hazards 실험군과 대조군을 관찰하면서 어느 군이 더 살아남는가에 대한 경과를 비교하고 그것이 통계적으로 차이가 있는지 알아보는 것. 생존분석에 쓰이는 함수들을 이용해서 1. 개요[편집] 생존율을 산출하고 생존시간을 추정하는 통계적 방법. 생존함수 추정에는 모수적 방법, 준모수적 방법 (Cox 비례위험모형), 비모수적 방법 (생명표법, Kaplan-Meier 추정방법)이 있다. 생존분석의 이름 유래는 사망과 생존을 다룬 것에서 유래했기 때문에 생존분석이지만, 꼭 생사가 달린 문제에만 쓰는 연구방법론은 아니다. 예를 들어 혼인 당시 임금근로자였던 아내가 출산 전후 휴가, 육아 휴직을 활용가능한 집단과 그렇지 않은 집단이 있다면, 이들이 혼인 이후 첫째아 출산까지 얼마나 시..