IGV (Integrative Genomics Viewer)
IGV는 통합적인 유전체 데이터셋 등을 보여주는 고성능 시각과 도구이다.
어레이데이터나 NGS 데이터 등 다양한 타입의 데이터를 지원한다.
IGV ?
- High-performance genomics data vidualization and exploration.
- 통합적인 유전체 데이터셋을 시각화해주는 그래픽 기반 프로그램
- 다양한 유전체 관련 정보를 여러가지 트랙을 통하여 보여줌
- 다양한 포맷의 데이터 로드할 수 있어 편리함 (array-based, NGS, annotation data)
- Annotation 결과를 그림과 그래프 형태로 제공해주고 Annotation 정보가 추가된 VCF 파일을 생성해줌
IGV interface
IGV 메뉴 설명
IGV 설명 관련 블로그
m.blog.naver.com/ruleoutlife/220642478991
Reference
'🧬 Bio > 생명정보학' 카테고리의 다른 글
contig 란? (0) | 2021.03.23 |
---|---|
Single Cell RNA Sequencing (0) | 2021.01.28 |
Read count (0) | 2021.01.20 |
RPKM, FPKM, TPM (0) | 2020.11.15 |