Cancer 용어 정리

Xenograft

Xenograft란 용어는 우리 말로는 "이종 이식"이며 서로 다른 종(species) 간에 조직이나 장기를 옮겨 심는 것을 말합니다. 돼지의 간을 사람에게 이식한다면 xenograft liver transplantation이라고 하는 거지요. 질문에서 xenograft tumor라는 것은, 예를 들자면, 사람에게서 발생한 암조직을 실험용 쥐에 이식한 것을 의미합니다.
암세포를 배양접시에서 배양하는 것 (in vitro)에 비해, 마우스에 옮겨서 xenograft 모델을 만들게 되면 암세포 외의 주변세포들과의 상호작용이 고려되기 때문에 좀 더 실제와 같은 조건에서 연구할 수 있는 장점이 있습니다.
참고로, 쥐에서 생긴 암조직을 다시 쥐로 이식할 때는 동종이식, 영어로는 allograft 라고 합니다.

 

Anoikis

아노이키스(anoikis)에 대한 저항성은 종양의 진행과 전이에서 중요한 역할을 합다. 아노이키스는 세포 밖 메트릭스(extracellular matrix)와 다른 세포 간의 접촉 손실에 의해 촉발되는 일종의 아폽토시스(apoptosis)입니다. 아노이키스 억제가 순환계에서의 암세포 생존에 대한 필수 전제요건이라는 가정 하에서 네덜란드 암 연구소(Netherlands Cancer Institute)의 연구팀은 이러한 특성에 대한 스크리닝이 전이 유전자에 대한 지놈 범위의 기능적인 스크리닝으로 작용할 수 있을 것으로 생각했다. 쥐 내장 표피 세포에 대한 스크리닝을 통해서 향신경성 수용체인 TrkB가 아노이키스의 강력한 억제 인자이며, TrkB의 발현 세포가 강력한 종양형성 및 전이를 일으킨다는 사실을 알 수 있었다. 이번 연구결과를 통해서 TrkB를 대량 발현하는 인간 종양의 공격적인 특성을 설명할 수 있었다.

 

FFPE (Formalin-fixed, paraffin-embedded)

FFPE라고 함은 병원에서 환자의 암조직을 채취하여 보관할 때, 표준적으로 사용하는 방법입니다. 포르말린으로 고정하고, 양초의 재료가 되는 파라핀에 굳히는 것입니다. 이렇게 파라핀 블록에 고정된 암조직은 상온에서 보관이 가능하고, 그를 얇게 여러번 썰어 여러 가지 조직학적 검사를 하기에 용이합니다. 조직 검사에서는 전혀 문제가 없었던 FFPE sample이 암세포의 메뉴얼 즉 genome을 읽어내는 과정에서는 문제가 됩니다. 조직의 구조를 관찰하는데 있어서는 FFPE sample이 문제가 크게 없지만, 우리가 보려고 하는 유전자는 분자 수준의 물질로써, 포르말린과 파라핀 고정과정에서 발생하는 화학작용에 의해 변성 (메뉴얼의 변화) 이 일어나기 때문입니다.

 

 

출처 : https://www.natureasia.com/ko-kr/nature/highlights/2137

네이처 하이라이트：TrkB에 의해서 억제되는 아노이키스(Anoikis) | 네이처 리서치

FFPE 출처 : http://geference.blogspot.com/2014/06/machine-learning-formalin-fixed.html